故事以大都市紐特市為舞臺，在那里正在興建為保護(hù)神奇寶貝而設(shè)立的設(shè)施神奇寶貝山莊，即將在近期完工。但是因失去了過去的故鄉(xiāng)，而將所見的一切都視作敵人攻擊的蓋諾賽克特也出現(xiàn)在這里！只見他朝著在現(xiàn)場的小智和皮卡丘發(fā)射破壞技術(shù)，千鈞一發(fā)之際，出現(xiàn)在小智等人面前保護(hù)他們的，竟然是傳說中的神奇寶貝？超夢！超夢認(rèn)為蓋諾賽克特和他一樣，都是原本不應(yīng)該出現(xiàn)在…故事以大都市紐特市為舞臺，在那里正在興建為保護(hù)神奇寶貝而設(shè)立的設(shè)施神奇寶貝山莊，即將在近期完工。但是因失去了過去的故鄉(xiāng)，而將所見的一切都視作敵人攻擊的蓋諾賽克特也出現(xiàn)在這里！只見他朝著在現(xiàn)場的小智和皮卡丘發(fā)射破壞技術(shù)，千鈞一發(fā)之際，出現(xiàn)在小智等人面前保護(hù)他們的，竟然是傳說中的神奇寶貝？超夢！超夢認(rèn)為蓋諾賽克特和他一樣，都是原本不應(yīng)該出現(xiàn)在這世上的神奇寶貝，于是決定扛下蓋諾賽克特的悲傷和憤怒，和他展開激烈的對峙…